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Variance de krigeage annuelle de la densité de l'espèce Cepola macrophthalma dans le Golfe du Lion (MEDITS, 1994-2019)

La densité (nombre individus/km²) a été calculée annuellement à partir des données de la campagne MEDITS entre 1994 et 2019. Les données ont été transformées par logarithme décimal log10 (x+1) puis une analyse variographique et un krigeage ordinaire ont été effectués pour interpoler les données de densité dans le Golfe du Lion. Une carte de variance de krigeage a été calculée pour chaque espèce et chaque pas de temps.
 
Citation proposal
De Rock Pauline (IFREMER) - Vaz Sandrine (IFREMER) - Hattab Tarek (IFREMER). Variance de krigeage annuelle de la densité de l'espèce Cepola macrophthalma dans le Golfe du Lion (MEDITS, 1994-2019). Ifremer https://services.mspdata.eu:/geonetwork/srv/api/records/cd032282-77b9-4605-ba21-47073fafa7b5

Simple

Date ( Creation )
2020-08-07
Identifier
DOI:10.12770/cd032282-77b9-4605-ba21-47073fafa7b5
Credit
Ifremer - Eolien flottant A06

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  Publisher

Ifremer -  

Thèmes Sextant ( Theme )
  • /Milieu biologique/Espèces/Espèces d'intérêt halieutique
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0 ( Theme )
  • Répartition des espèces
Sous-regions marines ( Place )
  • /Métropole/Méditerranée occidentale
Eolien - Jeu de données ( Theme )
  • Medits
Eolien - Type ( Theme )
  • Densité , Variance de krigeage
Eolien - Groupe ( Theme )
  • Ichtyofaune
SIH - Espèces scientifiques ( Theme )
  • Cepola macrophthalma
Access constraints
Copyright
Use constraints
Copyright
Other constraints
Spatial representation type
Grid
Distance
0.05  meter
Metadata language
French
Character set
UTF8
Topic category
  • Oceans
N
S
E
W


Number of dimensions
1
Dimension name
Vertical
Dimension size
1640
Cell geometry
surface
Transformation parameter availability
false
Distribution format
  • ( )

OnLine resource
DOI du jeu de données  

DOI du jeu de données

OnLine resource
Source 1  
OnLine resource
Campillo, 1992  
OnLine resource
Ilkyaz et al., 2017  
OnLine resource
Burgeot et al., 2013  
OnLine resource
Yapici & Filiz, 2014  
OnLine resource
Stergiou, 1999  
OnLine resource
Vallisneri et al., 2007  
OnLine resource
SD_Densite_annuelle_CEPOMAC  

Variance de krigeage annuelle

OnLine resource
SD_Densite_annuelle_CEPOMAC_1994_2019  

Variance de krigeage annuelle

Hierarchy level
Dataset

Conformance result

Date ( Publication )
2010-12-08
Explanation
See the referenced specification
Statement

La campagne MEDITS est une campagne de chalutage de fond standardisée et coordonnée à l'échelle internationale ciblant les ressources démersales et benthiques en mer Méditerranée et qui se déroule tous les ans au printemps depuis 1994. Chaque année, 65 stations fixes sont échantillonnées en moyenne dans le Golfe du Lion. L’identification de chaque individu capturé dans les traits de chalut est réalisée au niveau spécifique puis les poids et le nombre d'individus par espèce sont déterminés. La taille, le sexe et la maturité sont récoltés quand cela est prévu en fonction du protocole défini pour chaque espèce.

Les espèces correctement échantillonnées et suffisamment abondantes, c'est à dire possédant une occurrence minimum supérieure ou égale à 20% entre 1994 et 2019, ont bénéficié d'une cartographie annuelle sur cette période.

Une préparation des données a été préalablement effectuée avant la création des cartes de distribution. Le calcul de la surface balayée par trait de chalut a été effectué afin de calculer la densité totale (nombre individus/km²) par station, par année et par espèce. Les moyennes des latitudes et longitudes ont été calculées par trait de chalut. De façon à travailler dans un système orthonormé, la longitude a été transformée (Lon*cos(Lat*pi/180)).

La différenciation entre les juvéniles et les adultes pour chaque espèce n'a pas été réalisée à cause du manque du données de taille. Un travail bibliographique a été effectué pour identifier les adultes reproducteurs (servant de proxi des zones de frayères) des adultes non reproducteurs (en phase de croissance) pour les espèces de poissons.

La différenciation entre adultes reproducteurs et non reproducteurs chez les poissons est indiquée ci-dessous:

Espèce Fonction Sources taille et période de reproduction

Arnoglossus laterna Adulte reproducteur Ilkyaz et al., 2017

Callionymus maculatus Adulte reproducteur Burgeot et al, 1993

Capros aper Adulte reproducteur Yapici & Filiz, 2014

Cepola macrophthalma Adulte reproducteur Stergiou, 1999

Conger conger Adulte reproducteur Vallisneri et al., 2007

Lepidotrigla cavillone Adulte reproducteur Campillo, 1992

Serranus hepatus Adulte reproducteur voir "Source 1"

Concernant la distribution des espèces, les données ont d'abord été transformées par logarithme décimal log10(x+1) puis une analyse variographique et un krigeage ordinaire ont été réalisés par stade de vie pour créer les cartes de densité interpolée. Un variogramme empirique permet d'observer la relation spatiale des points d'échantillonnage : il va calculer l’autocorrélation entre chaque paire de points dans des classes de distances croissantes et identifier si les points ont une organisation particulière dans l’espace. Le variogramme, basé sur les données multi-annuelles (moyenne des densités par station), a été ajusté par une des fonctions continues autorisées dans le cadre de la géostatistique : effet pépitique, exponentiel, circulaire, sphérique, puissance ou gaussien, choisie sur la base du meilleur ajustement statistique. Les géostatistiques ne peuvent être en principe appliquées que si les données ont un comportement isotropique (varient de la même façon dans toutes les directions). De façon à vérifier cette condition, un variogramme directionnel dans quatre directions (0°, 45°, 90°, 135°) a également été produit pour détecter une possible anisotropie des données, ce qui n’a pas été le cas. Enfin, de façon à vérifier qu’aucune tendance longue portée ne vienne perturber significativement l’estimation krigée, une cross-validation a été réalisée a posteriori pour vérifier l’utilité de sa prise en compte, ce qui a été rejeté dans tous les cas. Un krigeage utilisant les paramètres du variogramme ajusté précédemment et avec une résolution de 0.1° va estimer les valeurs de densité annuelles aux emplacements non échantillonnés ainsi que l’estimation de la variance (ou erreur) de krigeage permettant d’avoir une mesure de l’incertitude liée à l’estimation. L’erreur de krigeage correspond ici à l’écart-type (racine carré) de la variance de krigeage. Une rastérisation avec une résolution de 0.05° et une distance maximum d’extrapolation de 0.2° est ensuite effectuée pour obtenir les cartes de densité interpolée annuelles par espèce. Une carte de variance de krigeage a été calculée pour chaque espèce et chaque pas de temps.

Description
Occurrence minimum supérieure ou égale à 20%
Rationale
Sélection des espèces suffisamment échantillonnées pour une cartographie annnuelle
Description
Recherche bibliographique sur la période de reproduction des poissons
Rationale
Identification des adultes reproducteurs et des adultes non reproducteurs
Description
Surface = distance (km) / ouverture filet (km)
Rationale
Calcul de la surface balayée par trait de chalut
Description
Densité totale = nombre individus / surface (km²)
Rationale
Calcul de la densité totale par espèce, par trait de chalut, par date
Description
Log10(x+1)
Rationale
Normalisation des données
Description
Construction et modélisation d'un variogramme
Rationale
Exploration des données - Autocorrélation spatiale entre chaque paire de points
Description
Krigeage ordinaire
Rationale
Interpolation des données annuelles réelles dans la zone d'étude
Description
Rastérisation
Rationale
Deuxième interpolation avec une résoluation à 0.05

Metadata

File identifier
cd032282-77b9-4605-ba21-47073fafa7b5   XML
Metadata language
French
Character set
UTF8
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2021-02-09T11:50:55
Metadata standard name
ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT
Metadata standard version
1.0

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