Date ( Creation )

2020-08-10

Identifier

DOI:10.12770/4d85bd5a-213d-4c33-83b4-a46cc21ed880

Credit

Ifremer - Eolien flottant A06

Thèmes Sextant ( Theme )

• /Milieu biologique/Espèces/Espèces d'intérêt halieutique

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0 ( Theme )

• Répartition des espèces

Sous-regions marines ( Place )

• /Métropole/Méditerranée occidentale

Eolien - Jeu de données ( Theme )

• Medits

Eolien - Type ( Theme )

• Densité , Variance de krigeage

Eolien - Groupe ( Theme )

• Ichtyofaune

Eolien - Stade ( Theme )

• Juvénile , Adulte

SIH - Espèces scientifiques ( Theme )

• Scomber scombrus

Access constraints

Copyright

Use constraints

Copyright

Other constraints

Spatial representation type

Grid

Distance

0.05  meter

Metadata language

French

Character set

UTF8

Topic category

• Oceans

Number of dimensions

1

Dimension name

Vertical

Dimension size

1640

Cell geometry

surface

Transformation parameter availability

false

Distribution format

• ( )

OnLine resource

DOI du jeu de données  

DOI du jeu de données

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Source 1  

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Campillo, 1992  

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Source 2  

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Krstulović-Šifner & Vrgoc, 2009  

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Serrat et al., 2019  

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Mir-Arguimbau et al., 2020  

OnLine resource

Velasco et al., 2011  

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Mytilineou et al., 2013  

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Busalacchi et al., 2014  

OnLine resource

Arculeo et al., 2014  

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Rotllant et al., 2002  

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Campagne MEDITS  

OnLine resource

The MEDITS Project  

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Densite_pluriannuelle_2015_2019_SCOMSCO  

Densité pluriannuelle et variance de krigeage

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Densite_pluriannuelle_2015_2019_SCOMSCO_ADULT  

Densité pluriannuelle - stade adulte

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Densite_pluriannuelle_2015_2019_SCOMSCO_JUV  

Densité pluriannuelle - stade juvénile

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SD_Densite_pluriannuelle_2015_2019_SCOMSCO_ADULT  

Variance de krigeage pluriannuelle - stade adulte

OnLine resource

SD_Densite_pluriannuelle_2015_2019_SCOMSCO_JUV  

Variance de krigeage pluriannuelle - stade juvénile

Hierarchy level

Dataset

Statement

La campagne MEDITS est une campagne de chalutage de fond standardisée et coordonnée à l'échelle internationale ciblant les ressources démersales et benthiques en mer Méditerranée et qui se déroule tous les ans au printemps depuis 1994. Chaque année, 65 stations fixes sont échantillonnées en moyenne dans le Golfe du Lion. L’identification de chaque individu capturé dans les traits de chalut est réalisée au niveau spécifique puis les poids et le nombre d'individus par espèce sont déterminés. La taille, le sexe et la maturité sont récoltés quand cela est prévu en fonction du protocole défini pour chaque espèce.

Les espèces possédant une occurrence moyenne supérieure ou égale à 20% sur la période 1994-2019 ont bénéficié d'une cartographie pluriannuelle (distribution moyenne sur l’ensemble de la période).

Une préparation des données a été préalablement effectuée avant la création des cartes de distribution. Le calcul de la surface balayée par trait de chalut a été effectué afin de calculer la densité totale (nombre individus/km²) par station, par année et par espèce. La densité a ensuite été moyennée par station et par espèce sur la période d'étude. Les moyennes des latitudes et longitudes ont été calculées par trait de chalut. De façon à travailler dans un système orthonormé, la longitude a été transformée (Lon*cos(Lat*pi/180)).

Pour les espèces bénéficiant d'au moins 80% d’observations de la distribution en taille sur l’ensemble des observations disponibles, la différenciation entre les juvéniles et les adultes a été effectuée. Les stades de maturité sont échantillonnés pour certaines espèces lors de la campagne MEDITS ce qui nous a permis de distinguer dans les données les individus matures et non matures. Dans le but de déterminer la taille à laquelle les espèces atteignent leur maturité sexuelle, une régression logistique a été utilisée pour étudier la relation entre le stade de maturité et la taille des individus. Ce type de modèle relie le statut de maturité (un facteur bimodal) à la taille et permet de déterminer la longueur à laquelle 50% des individus ont atteint la maturité sexuelle (LM50). Pour les espèces ne bénéficiant pas de données de maturité, un travail bibliographique a été réalisé afin de déterminer la taille seuil. La taille à maturité sexuelle mise en évidence a servi à identifier la proportion des juvéniles présents dans chaque trait sur la base des spectres de taille disponibles. Cette proportion a été rapportée à la densité totale pour obtenir la densité des juvéniles et des adultes dans chaque trait de chalut par an. Un travail bibliographique a été effectué pour distinguer les adultes reproducteurs (servant de proxi des zones de frayères), les adultes non reproducteurs (en phase de croissance) pour les espèces de poissons avec les juvéniles représentant les zones de nourriceries.

La taille à maturité sexuelle de chaque espèce, la différenciation entre adultes reproducteurs et non reproducteurs chez les poissons, et les sources, sont indiqués ci-dessous:

Chelidonichthys cuculus : 18.0 cm, Juvénile/Adulte reproducteur (Campillo, 1992; voir "Source 1")

Boops boops : 13.0 cm, Juvénile/Adulte reproducteur (Campillo, 1992)

Eledone moschata : 9.0 cm (Krstulović-Šifner & Vrgoc, 2009 et Campillo, 1992)

Illex coindetii : 14.9 cm (Données MEDITS; Campillo, 1992)

Micromesistius poutassou : 18.9 cm, Juvénile/Adulte non reproducteur (Serrat et al., 2019; Mir-Arguimbau et al., 2020)

Nephrops norvegicus : 3.4 cm (Données MEDITS; voir "Source 2")

Pagellus acarne : 19.9 cm, Juvénile/Adulte non reproducteur (Velasco et al., 2011 et Campillo, 1992)

Pagellus bogaraveo : 30.0 cm, Juvénile/Adulte non reproducteur (Mytilineou et al., 2013; Campillo, 1992)

Pagellus erythrinus : 16.5 cm, Juvénile/Adulte reproducteur (Busalacchi et al., 2014; Campillo, 1992)

Parapenaeus longirostris : 4.0 cm (Données MEDITS; Arculeo et al., 2014)

Phycis blennoides : 19.5 cm, Juvénile/Adulte non reproducteur (Rotllant et al., 2002)

Scomber scombrus : 20.7 cm, Juvénile/Adulte non reproducteur (Campillo, 1992)

Trachurus mediterraneus : 23.0 cm, Juvénile/Adulte reproducteur (Campillo, 1992)

Zeus faber : 40.0 cm, Juvénile/Adulte reproducteur (Campillo, 1992)

Concernant la distribution des espèces, les données ont d'abord été transformées par logarithme décimal log10(x+1) puis une analyse variographique et un krigeage ordinaire ont été réalisés par stade de vie pour créer les cartes de densité interpolée. Un variogramme empirique permet d'observer la relation spatiale des points d'échantillonnage : il va calculer l’autocorrélation entre chaque paire de points dans des classes de distances croissantes et identifier si les points ont une organisation particulière dans l’espace. Le variogramme, basé sur les données multi-annuelles (moyenne des densités par station), a été ajusté par une des fonctions continues autorisées dans le cadre de la géostatistique : effet pépitique, exponentiel, circulaire, sphérique, puissance ou gaussien, choisie sur la base du meilleur ajustement statistique. Les géostatistiques ne peuvent être en principe appliquées que si les données ont un comportement isotropique (varient de la même façon dans toutes les directions). De façon à vérifier cette condition, un variogramme directionnel dans quatre directions (0°, 45°, 90°, 135°) a également été produit pour détecter une possible anisotropie des données, ce qui n’a pas été le cas. Enfin, de façon à vérifier qu’aucune tendance longue portée ne vienne perturber significativement l’estimation krigée, une cross-validation a été réalisée a posteriori pour vérifier l’utilité de sa prise en compte, ce qui a été rejeté dans tous les cas. Un krigeage utilisant les paramètres du variogramme ajusté précédemment et avec une résolution de 0.1° va estimer, en utilisant les valeurs multi-annuelles, les valeurs de densité aux emplacements non échantillonnés ainsi que l’estimation de la variance (ou erreur) de krigeage permettant d’avoir une mesure de l’incertitude liée à l’estimation. L’erreur de krigeage correspond ici à l’écart-type (racine carré) de la variance de krigeage. Une rastérisation avec une résolution de 0.05° et une distance maximum d’extrapolation de 0.2° est ensuite effectuée pour obtenir la carte de densité pluriannuelle interpolée par espèce.

Description

Occurrence moyenne supérieure ou égale à 20%

Rationale

Sélection des espèces pour une cartographie pluriannnuelle (distribution moyenne sur l’ensemble de la période)

Description

Surface = distance (km) / ouverture filet (km)

Rationale

Calcul de la surface balayée par trait de chalut

Description

Densité totale = nombre individus / surface (km²)

Rationale

Calcul de la densité totale par espèce, par station, par année

Description

Recherche bibliographique ou régression logistique

Rationale

Identification de la taille à maturité sexuelle (LM50) pour différencier les juvéniles des adultes

Description

Recherche bibliographique sur la période de reproduction des poissons

Rationale

Identification des adultes reproducteurs et des adultes non reproducteurs

Description

Log10(x+1)

Rationale

Normalisation des données

Description

Construction et modélisation du variogramme

Rationale

Exploration des données - Autocorrélation spatiale entre chaque paire de points

Description

Krigeage ordinaire

Rationale

Interpolation des données réelles dans la zone d'étude

Description

Rastérisation

Rationale

Deuxième interpolation avec une résoluation à 0.05°

Metadata

File identifier

4d85bd5a-213d-4c33-83b4-a46cc21ed880   XML

Metadata language

French

Character set

UTF8

Hierarchy level

Dataset

Date stamp

2021-02-10T10:49:57

Metadata standard name

ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT

Metadata standard version

1.0